Estate 2011. Il Sacro Impero di Britannia invade il Giappone a bordo dei giganti robot da guerra chiamati Knightmare Frames. Il Giappone sconfitto è ribattezzato Area 11 e i suoi abitanti indicati come elevens. Il britanno Lelouch giura al suo amico giapponese Suzaku di distruggere la Britannia. Sette anni dopo Lelouch è uno studente delle superiori che regolarmente salta la scuola per giocare d’azzardo a scacchi puntando su se stesso.Un giorno Lelouch resta coinvolto nello scontro tra la task-force britanna e i ribelli eleven che, sorpresi da Suzaku, ora membro dell’esercito invasore, hanno sottratto un pericoloso segreto militare all’Impero. Lelouch si imbatte in una misteriosa ragazza che gli dona il potere di imporre il proprio volere a chiunque altro. L’occasione che aspettava: il ragazzo prende il comando dei terroristi e li guida alla vittoria, assumendo l’identità del mascherato Zero, capo della ribellione.